MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 3315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013203	TACT	2	8	645381	645388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_013203	TCTA	2	8	645396	645403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_013203	AGC	2	6	645426	645431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013203	GCG	2	6	645463	645468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013203	CCT	2	6	645501	645506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_013203	CAA	2	6	645532	645537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013203	AAT	2	6	645541	645546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013203	CT	3	6	645588	645593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_013203	ACT	2	6	645625	645630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013203	CTAA	2	8	645631	645638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_013203	T	6	6	646143	646148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013203	TAT	2	6	646152	646157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013203	AT	4	8	646165	646172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013203	TAA	2	6	646184	646189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013203	CAA	2	6	646197	646202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013203	AGG	2	6	646209	646214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013203	GTT	2	6	646218	646223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013203	TAA	2	6	646256	646261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013203	TAT	2	6	646269	646274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013203	AAG	2	6	646324	646329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013203	GA	3	6	646372	646377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013203	GAGG	2	8	646391	646398	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013203	CAA	2	6	646746	646751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013203	TAA	2	6	646758	646763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013203	T	6	6	646789	646794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013203	AGG	2	6	647215	647220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013203	T	6	6	651680	651685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013203	GAAAG	2	10	651773	651782	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013203	AGG	2	6	653142	653147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013203	TGA	2	6	655630	655635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013203	ATT	2	6	662624	662629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013203	TCCT	2	8	664056	664063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_013203	CAAA	2	8	664064	664071	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_013203	T	6	6	664099	664104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013203	TA	3	6	664177	664182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013203	AG	3	6	664583	664588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013203	CAA	2	6	665028	665033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_013203	T	6	6	665064	665069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013203	ACA	2	6	665116	665121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013203	TCTA	2	8	665205	665212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_013203	ATT	2	6	665218	665223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013203	AT	3	6	665227	665232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013203	T	6	6	665286	665291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013203	A	7	7	665332	665338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013203	A	6	6	665345	665350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013203	CCT	2	6	665387	665392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_013203	CG	3	6	665405	665410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_013203	AGA	2	6	665422	665427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013203	CGT	2	6	665465	665470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_013203	AAATG	2	10	665535	665544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013203	AGT	2	6	665548	665553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013203	TTTG	2	8	666888	666895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013203	A	7	7	666935	666941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013203	TAA	2	6	666988	666993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013203	TGG	2	6	667025	667030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1557	NC_013203	T	6	6	667231	667236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013203	GT	3	6	667237	667242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013203	TTGT	2	8	667256	667263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013203	GGA	2	6	667312	667317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013203	GAT	2	6	668382	668387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013203	ATA	2	6	668412	668417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013203	T	7	7	668458	668464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013203	T	6	6	668473	668478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013203	ATTT	2	8	668485	668492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013203	CGTAA	2	10	668502	668511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1567	NC_013203	A	7	7	668518	668524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013203	GTTT	2	8	668545	668552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013203	TGT	2	6	668560	668565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013203	ATA	2	6	670343	670348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013203	TCT	2	6	670421	670426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013203	CG	3	6	670437	670442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_013203	GTT	2	6	671427	671432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013203	AGT	2	6	671437	671442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013203	CAA	2	6	671485	671490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013203	TGTC	2	8	671512	671519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1579	NC_013203	GTT	2	6	673289	673294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_013203	GA	3	6	674781	674786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013203	AG	3	6	674792	674797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013203	TC	3	6	674799	674804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_013203	AGG	2	6	674822	674827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_013203	T	6	6	681677	681682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013203	GTA	2	6	681728	681733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_013203	AAG	2	6	682023	682028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013203	AT	3	6	683474	683479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013203	GCA	2	6	683503	683508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013203	TAC	2	6	684330	684335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013203	GC	3	6	684384	684389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_013203	T	7	7	684423	684429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013203	GGA	2	6	684457	684462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013203	A	6	6	688987	688992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013203	T	6	6	688999	689004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013203	GA	3	6	689008	689013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013203	TTA	2	6	689060	689065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013203	CCGC	2	8	689160	689167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1608	NC_013203	T	6	6	689206	689211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013203	GGA	2	6	689222	689227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013203	AGG	2	6	690778	690783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013203	A	6	6	692732	692737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013203	CCT	2	6	692751	692756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1618	NC_013203	TAG	2	6	695547	695552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013203	TGT	2	6	695577	695582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_013203	TTAGG	2	10	698356	698365	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013203	AGGT	2	8	701577	701584	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013203	CTT	2	6	703637	703642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1628	NC_013203	TGT	2	6	709505	709510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013203	GTG	2	6	709529	709534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013203	TAT	2	6	709535	709540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013203	TCA	2	6	709641	709646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013203	TGA	2	6	709657	709662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013203	AAT	2	6	709747	709752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013203	GT	3	6	709782	709787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013203	TGT	2	6	709826	709831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013203	TTG	2	6	709833	709838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_013203	CA	3	6	898124	898129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1918	NC_013203	AAT	2	6	898162	898167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_013203	TC	3	6	898188	898193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1920	NC_013203	CTC	2	6	898271	898276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1921	NC_013203	TCC	2	6	899376	899381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1922	NC_013203	AT	4	8	899444	899451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_013203	A	7	7	899475	899481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_013203	GA	4	8	899494	899501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_013203	ACTG	2	8	899544	899551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1926	NC_013203	TAA	2	6	899558	899563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1927	NC_013203	CAA	2	6	903580	903585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1930	NC_013203	T	6	6	903711	903716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_013203	AAAC	2	8	903735	903742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1932	NC_013203	AATA	2	8	903745	903752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_013203	T	6	6	903842	903847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_013203	AAT	2	6	903955	903960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_013203	TAT	2	6	903963	903968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_013203	CTG	2	6	903973	903978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_013203	ATT	2	6	909171	909176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_013203	A	6	6	909180	909185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1949	NC_013203	AAC	2	6	910659	910664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1952	NC_013203	CT	3	6	920044	920049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1953	NC_013203	CCT	2	6	920551	920556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1954	NC_013203	TACA	2	8	920561	920568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1955	NC_013203	TAA	2	6	920607	920612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1956	NC_013203	AGT	2	6	923298	923303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_013203	CTCC	2	8	924853	924860	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1958	NC_013203	ACC	2	6	924898	924903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1959	NC_013203	CAA	2	6	926282	926287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1960	NC_013203	CT	3	6	926337	926342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1961	NC_013203	CTC	2	6	927959	927964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1962	NC_013203	TCA	2	6	929556	929561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1963	NC_013203	TTA	2	6	929576	929581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_013203	TTA	2	6	929676	929681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_013203	TAAA	2	8	929697	929704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_013203	ACC	2	6	934951	934956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1969	NC_013203	AC	3	6	935029	935034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1970	NC_013203	CCA	2	6	935092	935097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1971	NC_013203	CGCT	2	8	935102	935109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1972	NC_013203	TCA	2	6	935138	935143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1974	NC_013203	ACA	2	6	935276	935281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1975	NC_013203	TCATA	2	10	935302	935311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1976	NC_013203	CCA	2	6	937352	937357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1977	NC_013203	TAC	2	6	939706	939711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1978	NC_013203	AAT	2	6	939721	939726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_013203	CCA	2	6	939769	939774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1980	NC_013203	CCT	2	6	939882	939887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1981	NC_013203	GCA	2	6	939893	939898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1983	NC_013203	CCT	2	6	939930	939935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1984	NC_013203	CA	3	6	939953	939958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1997	NC_013203	TA	3	6	943229	943234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_013203	TCC	2	6	950081	950086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1999	NC_013203	CA	3	6	950090	950095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_013203	ATG	2	6	950136	950141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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